Do boja proti koronavirusu sa zapojil najvýkonnejší super-počítač na svete

Laboratórium Oak Ridge oznámilo, že do boja proti koronavírusu zapojilo super-počítač Summit. Ide o najvýkonnejší počítač na svete, je vybavený 220 800 jadrami CPU, 188 416 000 jadrami CUDA, 9,2 PB pamäte a 250 PB zmiešaného NVRAM úložného priestoru. Jeho úlohou je zrýchlenie procesu hľadania proteínu, ktorý sa môže viazať na koronavírus, aby zabránil vírusu v infikovaní pľúcnych buniek.

2019-nCoV má na svojom povrchu proteíny, ktoré sa nazývajú hroty, ktoré oklamú povrchový receptor pľúcnych buniek, takže vírus púšťajú do bunky a začína sa infekcia. Jedným zo spôsobov, ako zastaviť infekciu, je nájsť spôsob, ako zablokovať tento proteín, ktorý sa nachádza na víruse, čím sa mu bráni vo väzbe na naše bunky, a tak je neschopný vytvoriť infekciu. 

Vedci pomocou Summitu simulujú správanie viac ako 8 000 rôznych proteínových zlúčenín a ich schopnosť viazať sa na hroty, to však vyžaduje veľa počítačového výkonu. Zatiaľ čo na výkonnom počítači môže tento proces trvať mesiace, Summit dokáže simulácie dokončiť už za pár dní. Doteraz takto našli 77 rôznych zlúčenín, ktoré budú podrobené ďalšiemu štúdiu. Nakoniec, keď sa nájde proteín, ktorý sa s vysokou mierou úspešnosti môže viazať na hroty 2019-nCov, môže sa syntetizovať na vakcínu.

Neznamená to však automaticky, že tento počítač objaví sám liek na koronavírus. Dáta, ktoré ale dokáže tak rýchlo a presne poskytnúť, potom môžu slúžiť ako podklady pre ďalší výskum a testovanie možných vakcín.