Príbeh MGS V nie je kompletný, chýba misia s vysvetlením a aj s finálnym bojom

Podľa bonusového obsahu v zberateľskej edícii vidieť, že niektoré príbehovo dôležité veci sa do finálnej hry nedostali. Možno z časového hľadiska, možno z rozpočtového, ale je tam hlavne misia, ktorá pokračuje po skončení hry a dáva vysvetlenie nedokončených vecí v príbehu.

Nasledujú spojlery, takže ak ste hru ešte neprešli a plánujete prejsť, nemusíte sledovať. Ale ak neplánujete prejsť, môžete si pozrieť ako koniec hry, tak aj doplnkovú misiu

Misia nasleduje po True endingu, teda skutočnom konci hry, ktorý vysvetľuje veľa vecí okolo hlavnej postavy, ale nevysvetľuje veľa ďalších otvorených vecí.

Konkrétne bonusový disk ukazuje misiu 51, ktorá by pokračovala po pôvodnom ukončení príbehu a vysvetľovala by ďalšie veci a to konkrétne vyústenie konfliktu Diamond Dogs s Elim, čo by bol finálny boss fight v hre, keďže ten hre teraz chýba. Odhalí, že Eli je Liquid Snake a priblíži osud ruského chlapca pripomínajúceho Psycho Mantisa.